Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ15

NABP2, SOSS complex subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP2Q9BQ15 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NABP2Q9BQ15 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NABP2Q9BQ15 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms