Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VGLL1Q99990 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VGLL1Q99990 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms