Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3AQ99856 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3AQ99856 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms