Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGREF1Q99674 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGREF1Q99674 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms