Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MMP19Q99542 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP19Q99542 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms