Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms