Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SIN3AQ96ST3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SIN3AQ96ST3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SIN3AQ96ST3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms