Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNGAP1Q96PV0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNGAP1Q96PV0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms