Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1Q96NA8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms