Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS50Q96JG6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS50Q96JG6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS50Q96JG6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms