Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPD52L3Q96J77 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms