Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms