Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJA3Q96EY1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJA3Q96EY1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJA3Q96EY1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJA3Q96EY1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJA3Q96EY1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJA3Q96EY1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 306.3 ms