Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP36Q96EU6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
RRP36Q96EU6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RRP36Q96EU6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms