Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MFSD3Q96ES6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD3Q96ES6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms