Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC11Q96DB2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC11Q96DB2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms