Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TLCD1Q96CP7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD1Q96CP7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms