Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM3DQ96BQ1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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FAM3DQ96BQ1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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FAM3DQ96BQ1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM3DQ96BQ1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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