Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB7BQ96AH8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB7BQ96AH8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB7BQ96AH8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms