Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKD2Q969F2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms