Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATA6Q92908 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA6Q92908 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms