Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP205Q92621 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP205Q92621 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms