Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATL1Q8WXF7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms