Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC12Q8WVT3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC12Q8WVT3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC12Q8WVT3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms