Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAG1Q8WVM7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STAG1Q8WVM7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STAG1Q8WVM7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms