Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUQ7

CACTIN, Cactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACTINQ8WUQ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACTINQ8WUQ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACTINQ8WUQ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACTINQ8WUQ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACTINQ8WUQ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACTINQ8WUQ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACTINQ8WUQ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACTINQ8WUQ7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms