Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHD5Q8TDI0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD5Q8TDI0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD5Q8TDI0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD5Q8TDI0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD5Q8TDI0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD5Q8TDI0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD5Q8TDI0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD5Q8TDI0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD5Q8TDI0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms