Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF398Q8TD17 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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