Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms