Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIBP2Q8ND30 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP2Q8ND30 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms