Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FSIP1Q8NA03 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FSIP1Q8NA03 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FSIP1Q8NA03 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms