Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIML1Q8N9V2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIML1Q8N9V2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIML1Q8N9V2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIML1Q8N9V2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIML1Q8N9V2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIML1Q8N9V2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIML1Q8N9V2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIML1Q8N9V2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIML1Q8N9V2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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