Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C15orf54Q8N8G6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf54Q8N8G6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms