Protein–RNA interactions for Protein: Q8N443

RIBC1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC1Q8N443 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIBC1Q8N443 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIBC1Q8N443 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms