Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOT1Q8IXI2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms