Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRSK2Q8IWQ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms