Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC103Q8IW40 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms