Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUDCD3Q8IVD9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD3Q8IVD9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms