Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC71Q8IV32 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC71Q8IV32 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC71Q8IV32 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC71Q8IV32 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms