Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DZIP3Q86Y13 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DZIP3Q86Y13 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DZIP3Q86Y13 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DZIP3Q86Y13 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DZIP3Q86Y13 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DZIP3Q86Y13 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DZIP3Q86Y13 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DZIP3Q86Y13 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DZIP3Q86Y13 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DZIP3Q86Y13 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms