Protein–RNA interactions for Protein: Q86W28

NLRP8, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP8Q86W28 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP8Q86W28 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP8Q86W28 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP8Q86W28 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP8Q86W28 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP8Q86W28 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP8Q86W28 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP8Q86W28 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP8Q86W28 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP8Q86W28 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP8Q86W28 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP8Q86W28 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP8Q86W28 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP8Q86W28 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms