Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNRD3Q86VQ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXNRD3Q86VQ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TXNRD3Q86VQ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms