Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF39Q86UA1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF39Q86UA1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF39Q86UA1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms