Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC11Q7Z392 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC11Q7Z392 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms