Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APTXQ7Z2E3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APTXQ7Z2E3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APTXQ7Z2E3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms