Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM179Q6ZVK1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM179Q6ZVK1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM179Q6ZVK1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM179Q6ZVK1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM179Q6ZVK1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM179Q6ZVK1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM179Q6ZVK1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM179Q6ZVK1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms