Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZRN4Q6ZMN7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms