Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C16orf54Q6UWD8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms