Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZBED9Q6R2W3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
ZBED9Q6R2W3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms