Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD4Q6NW29 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms